Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.138e-10■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.128e-10■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 315.62■□□□□ 0.098e-10■■■■■ 37.5
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-206ENST00000540900 2057 ntTSL 512.09□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-211ENST00000584154 583 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-201ENST00000247026 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-209ENST00000581048 547 ntTSL 48.36□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-208ENST00000580103 774 ntTSL 57.78□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-202ENST00000394826 1800 ntTSL 1 (best)7.59□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-207ENST00000577289 562 ntTSL 56.25□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-216ENST00000589608 368 ntTSL 55.77□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-203ENST00000467446 548 ntTSL 35.7□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-212ENST00000584317 564 ntTSL 55.6□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-204ENST00000475652 1242 ntTSL 1 (best)4.7□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-215ENST00000588614 497 ntTSL 23.87□□□□□ -1.792e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 NSRP1-214ENST00000585881 582 ntTSL 32.67□□□□□ -1.982e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 MBTPS1-210ENST00000565863 597 ntTSL 416.31■□□□□ 0.23e-12■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 MBTPS1-213ENST00000569770 763 ntTSL 315.43■□□□□ 0.063e-12■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 MBTPS1-201ENST00000343411 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.683e-12■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 MBTPS1-206ENST00000563231 546 ntTSL 58.28□□□□□ -1.083e-12■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 MBTPS1-209ENST00000564643 602 ntTSL 37.09□□□□□ -1.273e-12■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 411.33□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 RSF1-202ENST00000440064 604 ntTSL 515.99■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 RSF1-206ENST00000528095 2107 ntTSL 1 (best)14.23□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 RSF1-203ENST00000467567 2982 ntTSL 212.83□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 ASNSP1-202ENST00000641079 1352 ntBASIC7.16□□□□□ -1.268e-8■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 ASNSP1-203ENST00000641735 1372 nt6.56□□□□□ -1.368e-8■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.74□□□□□ -1.658e-8■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.66□□□□□ -1.668e-8■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.674e-7■■■■■ 37.4
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 49.43□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 37.3
EXOSC5Q9NQT4 CMC1-201ENST00000334841 724 ntTSL 312.53□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 37.3
EXOSC5Q9NQT4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.633e-7■■■■■ 37.3
EXOSC5Q9NQT4 CMC1-205ENST00000466830 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 37.3
EXOSC5Q9NQT4 CMC1-209ENST00000477739 3749 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 37.3
EXOSC5Q9NQT4 CMC1-202ENST00000396610 593 ntTSL 23.83□□□□□ -1.83e-7■■■■■ 37.3
EXOSC5Q9NQT4 CMC1-203ENST00000418849 484 ntTSL 32.35□□□□□ -2.033e-7■■■■■ 37.3
EXOSC5Q9NQT4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 37.1
EXOSC5Q9NQT4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 37.1
EXOSC5Q9NQT4 DNAJB6-212ENST00000465908 694 ntTSL 312.74□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 37.1
EXOSC5Q9NQT4 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 AKAP9-214ENST00000493453 6020 ntTSL 28.06□□□□□ -1.124e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.654e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.014e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.044e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 PRKAR2B-202ENST00000393613 642 ntTSL 34.86□□□□□ -1.633e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 PRKAR2B-203ENST00000488792 609 ntTSL 34.32□□□□□ -1.723e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.451e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 B3GNTL1-205ENST00000571394 774 ntTSL 312.47□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 B3GNTL1-208ENST00000572977 2446 ntTSL 212.15□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 B3GNTL1-209ENST00000573363 471 ntTSL 211.24□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 B3GNTL1-202ENST00000570947 390 ntTSL 38.59□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 MGEA5-204ENST00000429860 769 ntTSL 38.06□□□□□ -1.122e-9■■■■■ 37
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EXOSC5Q9NQT4 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 ZNF551-201ENST00000282296 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 ZNF551-204ENST00000601064 1826 ntTSL 1 (best)8.73□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 CD46-216ENST00000490278 747 ntTSL 23.83□□□□□ -1.83e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 CD46-213ENST00000471987 572 ntTSL 33.53□□□□□ -1.843e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 CD46-215ENST00000488596 872 ntTSL 33.15□□□□□ -1.913e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 CD46-210ENST00000462968 473 ntTSL 32.7□□□□□ -1.983e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 CD46-219ENST00000636114 2098 ntTSL 52.24□□□□□ -2.053e-7■■■■■ 37
EXOSC5Q9NQT4 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 PTPRK-217ENST00000524534 2441 ntTSL 510.16□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 PTPRK-216ENST00000524481 3157 ntTSL 210.02□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 PTPRK-219ENST00000531050 2515 ntTSL 1 (best)7.02□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 PTPRK-214ENST00000495748 746 ntTSL 56.2□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 PTPRK-211ENST00000429595 558 ntTSL 35.69□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 PTPRK-213ENST00000490332 612 ntTSL 54.43□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.346e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.346e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.186e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.116e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.036e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-212ENST00000532978 2489 ntTSL 215.08■□□□□ 0.016e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.316e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-205ENST00000392483 581 ntTSL 212.85□□□□□ -0.356e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.486e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.486e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-210ENST00000532423 507 ntTSL 211.36□□□□□ -0.596e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-209ENST00000530868 650 ntTSL 310.73□□□□□ -0.696e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-206ENST00000524679 915 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.896e-10■■■■■ 36.9
EXOSC5Q9NQT4 TPD52L1-204ENST00000392482 1165 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.036e-10■■■■■ 36.9
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