Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX9Q9NQ69 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LHX9Q9NQ69 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX9Q9NQ69 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX9Q9NQ69 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms