Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASCL3Q9NQ33 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASCL3Q9NQ33 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASCL3Q9NQ33 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASCL3Q9NQ33 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms