Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4BQ9NPR2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4BQ9NPR2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms