Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TREM1Q9NP99 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TREM1Q9NP99 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TREM1Q9NP99 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms