Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPHS2Q9NP85 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPHS2Q9NP85 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms