Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1BQ9H9Y6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1BQ9H9Y6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1BQ9H9Y6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms