Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR55Q9H6Y2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR55Q9H6Y2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR55Q9H6Y2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms