Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLMPQ9H6B4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLMPQ9H6B4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLMPQ9H6B4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms