Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6AQ9H2E6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA6AQ9H2E6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.9 ms