Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED28Q9H204 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED28Q9H204 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms