Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PARD6BQ9BYG5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARD6BQ9BYG5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARD6BQ9BYG5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD6BQ9BYG5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms