Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RSPO3Q9BXY4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPO3Q9BXY4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RSPO3Q9BXY4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms