Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS5

AP1M1, AP-1 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1M1Q9BXS5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1M1Q9BXS5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1M1Q9BXS5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP1M1Q9BXS5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1M1Q9BXS5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms