Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM109Q9BVC6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM109Q9BVC6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms