Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM79Q9BSE2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM79Q9BSE2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM79Q9BSE2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms