Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3GL1Q99961 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL1Q99961 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL1Q99961 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL1Q99961 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms