Protein–RNA interactions for Protein: Q99828

CIB1, Calcium and integrin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1Q99828 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIB1Q99828 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIB1Q99828 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB1Q99828 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB1Q99828 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms