Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LITAFQ99732 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms