Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MTRQ99707 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTRQ99707 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTRQ99707 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTRQ99707 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MTRQ99707 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTRQ99707 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTRQ99707 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTRQ99707 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTRQ99707 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTRQ99707 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTRQ99707 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTRQ99707 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MTRQ99707 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTRQ99707 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTRQ99707 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTRQ99707 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTRQ99707 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTRQ99707 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTRQ99707 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MTRQ99707 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTRQ99707 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTRQ99707 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTRQ99707 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTRQ99707 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTRQ99707 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTRQ99707 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTRQ99707 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTRQ99707 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTRQ99707 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTRQ99707 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTRQ99707 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTRQ99707 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
MTRQ99707 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTRQ99707 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTRQ99707 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTRQ99707 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTRQ99707 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTRQ99707 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTRQ99707 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTRQ99707 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTRQ99707 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTRQ99707 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTRQ99707 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTRQ99707 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MTRQ99707 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTRQ99707 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTRQ99707 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTRQ99707 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTRQ99707 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTRQ99707 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTRQ99707 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTRQ99707 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTRQ99707 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTRQ99707 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTRQ99707 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTRQ99707 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MTRQ99707 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTRQ99707 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MTRQ99707 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTRQ99707 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTRQ99707 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MTRQ99707 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTRQ99707 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTRQ99707 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTRQ99707 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTRQ99707 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTRQ99707 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTRQ99707 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTRQ99707 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MTRQ99707 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTRQ99707 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTRQ99707 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTRQ99707 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTRQ99707 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTRQ99707 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTRQ99707 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTRQ99707 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MTRQ99707 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTRQ99707 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTRQ99707 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTRQ99707 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MTRQ99707 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTRQ99707 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTRQ99707 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTRQ99707 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MTRQ99707 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MTRQ99707 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MTRQ99707 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MTRQ99707 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MTRQ99707 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTRQ99707 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTRQ99707 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTRQ99707 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTRQ99707 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTRQ99707 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTRQ99707 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTRQ99707 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTRQ99707 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTRQ99707 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms