Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD9AQ99638 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD9AQ99638 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD9AQ99638 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms