Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAP1L3Q99457 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NAP1L3Q99457 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NAP1L3Q99457 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms