Protein–RNA interactions for Protein: Q96T58

SPEN, Msx2-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPENQ96T58 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPENQ96T58 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPENQ96T58 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPENQ96T58 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPENQ96T58 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms