Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALPK1Q96QP1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALPK1Q96QP1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALPK1Q96QP1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms