Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SAMD11Q96NU1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMD11Q96NU1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAMD11Q96NU1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAMD11Q96NU1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms