Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSNARE1Q96NA8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1Q96NA8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1Q96NA8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms