Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF396Q96N95 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF396Q96N95 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF396Q96N95 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF396Q96N95 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms