Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIGD1Q96MW7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TIGD1Q96MW7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms