Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF145Q96MT1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF145Q96MT1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF145Q96MT1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF145Q96MT1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms