Protein–RNA interactions for Protein: Q96J84

KIRREL1, Kin of IRRE-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL1Q96J84 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIRREL1Q96J84 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIRREL1Q96J84 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KIRREL1Q96J84 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KIRREL1Q96J84 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KIRREL1Q96J84 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KIRREL1Q96J84 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KIRREL1Q96J84 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KIRREL1Q96J84 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KIRREL1Q96J84 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIRREL1Q96J84 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIRREL1Q96J84 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIRREL1Q96J84 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KIRREL1Q96J84 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms