Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APIPQ96GX9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APIPQ96GX9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms