Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3CQ96E17 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3CQ96E17 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3CQ96E17 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms