Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C18orf8Q96DM3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C18orf8Q96DM3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C18orf8Q96DM3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
C18orf8Q96DM3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms