Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2FQ969M7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2FQ969M7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms