Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL1Q92935 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL1Q92935 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms