Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UFD1Q92890 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
UFD1Q92890 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFD1Q92890 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms