Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A1Q8WWI5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC44A1Q8WWI5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A1Q8WWI5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms