Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTRT1Q8TDG2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTRT1Q8TDG2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACTRT1Q8TDG2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms