Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRSK1Q8TDC3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK1Q8TDC3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK1Q8TDC3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms