Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37AQ8NEZ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS37AQ8NEZ2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS37AQ8NEZ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms