Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C3Q8NEB9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3C3Q8NEB9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3C3Q8NEB9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms