Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9R8

SCAI, Protein SCAI, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAIQ8N9R8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAIQ8N9R8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAIQ8N9R8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAIQ8N9R8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms