Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC17Q8N6Y2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms