Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM20Q8N5G0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM20Q8N5G0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM20Q8N5G0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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