Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EID3Q8N140 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EID3Q8N140 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EID3Q8N140 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms