Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00518Q8N0U6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00518Q8N0U6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00518Q8N0U6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00518Q8N0U6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00518Q8N0U6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00518Q8N0U6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00518Q8N0U6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00518Q8N0U6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00518Q8N0U6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00518Q8N0U6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00518Q8N0U6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00518Q8N0U6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms