Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZF0

NALCN, Sodium leak channel non-selective protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NALCNQ8IZF0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NALCNQ8IZF0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NALCNQ8IZF0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NALCNQ8IZF0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NALCNQ8IZF0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NALCNQ8IZF0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms