Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOT2Q8IXI1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOT2Q8IXI1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOT2Q8IXI1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms