Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APLFQ8IW19 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APLFQ8IW19 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APLFQ8IW19 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms