Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB43Q86YS6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB43Q86YS6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms